因為養殖廢水處理大型臭氧發生器的強氧化性,滅菌對水中微生物效果還是很強烈的,另外，臭氧還能有效地殺滅原蟲及其卵。養殖用淡水或海水中，由于臭氧的強氧化性，亞硝酸鹽、硫化氫、氨態氰等對魚類都有很大的危害，都可以氧化成無毒物質。因為在這個過程中，無機物被分解，所以減少了水中的生物和化學的耗氧量。臭氧發生器功能利用壁掛式臭氧發生器產生的臭氧的廣譜、、快速消毒功能對室內空氣進行消毒，使細菌、真菌等多種菌體的蛋白質外殼氧化，從而殺滅細菌繁殖體和芽孢、、真菌等；利用臭氧與空氣中多種有毒成份（如甲醛、苯、氨、煙味及具有異味的有機物等）產生氧化反應，消除異味并解除其毒性。

養殖用淡水或海水中，由于臭氧的強氧化性，亞硝酸鹽、硫化氫、氨態氰等對魚類都有很大的危害，都可以氧化成無毒物質。在此過程中，無機物被降解，從而減少了水中的生物和化學的耗氧量。
臭氧氣的強氧化性可以對藻類等原生動植物進行快速殺滅。據說，經過30分鐘臭氧處理后，赤潮海水被*氧化成無色透明狀，水里的夜光蟲都被殺死了，成粉末狀。
養殖廢水處理大型臭氧發生器能快速有效地殺死水中存在的危害水牛生命健康的病原菌。據說，臭氧、次氯酸鹽、氯氣、氯氮等對隱孢子蟲卵的殺滅時間各不相同，1mg/L的臭氧作用5分鐘可以殺死90%的蟲囊；而相同濃度的次氯酸鈉，則作用1小時；濃度為80毫克/公斤的氯氣和氯氮，作用90分鐘后才能達到相同的作用。